Mezi doloženými pobočnými tábory koncentračního tábora Flossenbürg se jich 21 nacházelo na území dnešní České republiky. Značně se lišily počtem vězňů i dobou své existence. Mezi pobočnými tábory vynikal pravděpodobně Leitmeritz, ve kterém byly spojeny tři samostatná vnější komanda, která také samostatně účtovala s SS: SS-Sonderbaustab B 5, Elsabe (Auto Union AG) a Kalkspat (Osram KG). Podle Miroslavy Beneové prošlo tímto táborem celkem 17 211 vězňů.
(Neuváděné denní údaje pro Kschepenitz, Malá Pevnost Terezín a Zwodau již nebylo možné zjistit).