Mezi lety 1940 a 1945 prošlo věznicí Gestapa Malá pevnost v Terezíně přibližně 32 000 osob (27 000 mužů a 5 000 žen). Byli vězněni zde nebo později deportováni do jiných koncentračních táborů, nápravných zařízení a věznic. Zatímco v roce 1940 činil průměrný počet vězňů 150, v roce 1941 vzrostl na 600 a v roce 1942 na 1 200. V letech 1943 a 1944 to bylo v průměru 2 000 vězňů. V posledních měsících války byla věznice přeplněná a dosáhla nejvyššího počtu 5 500 vězňů. V průběhu let prošlo věznicí asi 1 500 Židů.
2 500 vězňů přišlo o život, bylo zavražděno, zemřelo na následky nemocí způsobených nedostatkem, nedostatečnou lékařskou péčí, podvýživou a skvrnitým tyfem.
Nejčastějším důvodem uvěznění byl odpor proti německým okupantům: 50 % vězňů se účastnilo organizovaného odporu, 12 % se zapojilo do individuálního odporu. 7 % vězňů bylo uvězněno za podporu pronásledovaných občanů, 6 % „porušilo protižidovské předpisy a nařízení“. Mezi prvními vězni byli představitelé a spolupracovníci obou hlavních proudů odboje – občansko-demokratického a komunistického.
Věznice Gestapa v Malé pevnosti byla vyšetřovací věznicí. Lidé, kteří byli z nejrůznějších důvodů zatčeni Gestapem, byli v této věznici drženi až do vynesení rozsudku soudu (pokud k němu vůbec došlo) a poté byli podle výše trestu rozděleni do jiných věznic, nápravných zařízení nebo koncentračních táborů. Židé převezení z ghetta do Malé pevnosti měli ve svých průvodních dokladech většinou záznam R U (návrat nežádoucí) nebo S B (zvláštní zacházení). Zemřeli v Malé pevnosti nebo byli deportováni do Osvětimi.
Přibližně 17,5 procent vězňů bylo z vězení Gestapa přímo propuštěno. Jednalo se převážně o pachatele hospodářských trestných činů, např. osoby odsouzené za pracovní delikty. Více než 20 procent vězňů bylo předáno nacistickým soudům, mnoho z nich bylo odsouzeno k smrti a popraveno. U 466 z těchto případů jsou známá jména. Přibližně 20 procent bylo převezeno do jiných koncentračních táborů, do Flossenbürgu, Buchenwaldu, Mauthausenu, Osvětimi, ženy převážně do Ravensbrücku. Vězni z Malé pevnosti byli rovněž předáni do věznic a nápravných zařízení v Drážďanech, Bautzenu, Zwickau, Waldhainu, Brandenburgu, Bayreuthu, Hamburku a Berlíně.
Pohřebnictví ve věznici Gestapa Malá pevnost
