Lewin byl deportován v říjnu 1941 z Kolína nad Rýnem do Lodže >. Od 19. dubna 1945 pak dále do Schwarzheide. Odtud následoval hladový pochod soutěskou z Budyšína do Warnsdorfu. Zde od 26. dubna do 5. května v továrně, téměř bez jídla. Hladovějící jedli trávu. Poté byli všichni za prudkého deště naloženi do otevřených nákladních aut s uhlím a odvezeni do Litoměřic. Během cesty se střílelo a došlo ke ztrátám na životech. Příjezd do Terezína 8. května 1945.
Lewin vyrůstal na přelomu století ve středostavovské, liberální rodině ve okrese Bromberg. Stejně jako mnoho dalších Židů se Lewin stal vojákem v první světové válce. Vystudoval medicínu a v roce 1925 se oženil s berlínskou lékařkou Alice Belgard.
V roce 1932 předložil habilitační práci, ale ta byla z antisemitských důvodů zamítnuta. Kromě praktické a vědecké práce se jeho život vyznačoval také politikou: Lewin byl od roku 1922 členem SPD, což znamenalo, že ho národní socialisté považovali za „židobolševika“. V roce 1935 se Lewin stal vedoucím lékařem gynekologicko-porodnického oddělení berlínské židovské nemocnice a v roce 1937 byl zaměstnán v Nemocnici izraelitského azylu v Kolíně nad Rýnem. Na základě čtvrtého nařízení k zákonu o říšském občanství mu byla také odebrána licence k výkonu lékařské praxe a získal povolení poskytovat lékařskou péči židovským pacientům jako „ošetřovatel nemocných“. V říjnu 1941 byli Herbert Lewin a jeho žena Alice deportováni do lodžského ghetta; Alice Lewinová věznění v koncentračním táboře nepřežila.
Po skončení války mohl pokračovat ve své lékařské a vědecké kariéře. Po habilitaci na univerzitě v Kolíně nad Rýnem v roce 1948 se v roce 1950 stal vedoucím lékařem Městské gynekologické kliniky v Offenbachu. Jeho jmenování do Offenbachu zastínil první velký antisemitský skandál ve Spolkové republice Německo: Lewina odmítli lékaři z offenbašského zastupitelstva, lékaři a sestry z offenbašské nemocnice i starosta města za CDU. Odůvodnění: Lewin by nastoupil do práce s pomstychtivostí vězně koncentračního tábora, žádná žena by se mu nemohla s klidným svědomím svěřit. Teprve zásah nadřízených orgánů a celosvětové protesty veřejnosti přiměly offenbašského soudce, aby své hlasování opravil.
Herbert Lewin byl v letech 1963-1969 předsedou Ústřední rady Židů v Německu.