Na podzim 1944 začali esesáci ničit důkazy o svých zločinech. V listopadu 1944 bylo do Ohře na příkaz SS vsypáno více než 22 000 uren s popelem obětí. Dne 8. prosince 1944 byl vydán rozkaz k předání všech úředních dokumentů a záznamů týkajících se transportů a všech matrik SS. Historie tábora měla být utajena. V následujících měsících byly všechny dostupné materiály zabaveny a spáleny. Mnoho dokumentů, které mohly objasnit historii tábora, bylo zničeno. Z mnoha tun papíru se podařilo zachránit jen nepatrný zbytek, a to náhodně nebo nelegálně.
Dne 17. dubna 1945 byly rozsáhlé fondy Hlavního říšského bezpečnostního úřadu z E I při vysokých pulsech zapáleny. Město bylo zahaleno v oblaku kouře a pokryto papírovým popelem. Dne 28. března 1945 byly všechny obrazy vzniklé v Terezíně zkontrolovány kvůli obavám z „dokumentů o zvěrstvech“. Pokud se tak nestalo již během malířské aféry v červenci 1944, umělci svá díla ukryli. / (.*/1011)"> 1011)/ (.*/ /.* /
