Sudetská kasárna (na plánu města blok E I – č. 32 na mapě města) se nachází v jihozápadní části Velké pevnosti. Také ona byla zabudována do opevnění. Sem dorazil 24. listopadu 1941 první transport židovských mužů, tzv. Aufbaukommando. Později přibylo ještě několik dalších transportů. Po dvou týdnech byly ženy s dětmi odděleny a ubytovány v Drážďanských kasárnách, rodiny zůstaly nadále rozděleny. V Sudetské kasárně byla umístěna jedna z velkých kuchyní. V červenci 1943 musela být celá budova vyklizena, protože zde byla uložena část archivu Hlavního úřadu říšské bezpečnosti, který byl přivezen z Berlína. Archiv měl být tímto způsobem chráněn před nálety spojenců.
Po osvobození byla budova využívána československou armádou. Před vchodem stojí dodnes dělo. Na konci devadesátých let se armáda stáhla z Terezína i ze Sudetské kasárny. Areál je podle všeho v roce 2005 využíván několika malými podniky. Sudetská kasárna je jednou z budov, které jsou určeny pro projekt Euro-univerzita.
